`同期進行中`とはどういう状態ですか？

MDMサーバがデバイスとの同期が必要と判断し、次回の自動同期処理時に同期予約したステータスです。
MDMサーバがデバイスと同期が必要と判断するのは次の操作です。

・デバイスをテンプレートに登録した・デバイスが登録されているテンプレートにアプリ、プロファイル等が追加／削除された
・デバイスと同じテンプレートに登録されているアプリ、プロファイル等が編集された
・デバイスが登録されていたテンプレートを他のテンプレートに切り替えた

自動同期によるPUSH送信後、デバイスからの応答があり次第同期確認中あるいは同期完了へ自動的に遷移します。
サーバからの命令がプロファイルインストールで、かつデバイスがロック中である場合は、デバイスは命令を実行できないためステータスは同期進行中のまま変わりません。
デバイスがロックを解除した際の同期状態の遷移はOSのバージョンによって差異があります。iOS5〜7では同期確認中へ、iOS8〜11では同期完了となります。