iPadに初めからインストールされているアプリを自動でアンインストールしたい

初めからインストールされているアプリを、デバイス上で表示させない（デバイス利用者にアプリを使わせない）ようにすることは可能です。
アプリ非表示設定は、プロファイル制限ペイロードのAppの使用を制限（監視対象のみ）から設定を行います。
詳細はこちらをご参照ください。